[صفحه اصلی ]   [Archive] [ English ]  
:: صفحه اصلي :: درباره نشريه :: آخرين شماره :: تمام شماره‌ها :: جستجو :: ثبت نام :: ارسال مقاله :: تماس با ما ::
:: دوره 11، شماره 41 - ( 1399 ) ::
جلد 11 شماره 41 صفحات 73-81 برگشت به فهرست نسخه ها
فیلوژنی داینوفلاژله Gyrodinium instriatum گونه جانبی در هنگام کشند سرخ گونه Gonyaulax polygramma جدا شده از آب های ساحلی رمین (دریای مکران)
گیلان عطاران فریمان، فائزه دولت آبادی، مهران لقمانی
دانشگاه دریانوردی و علوم دریایی چابهار ، gilan.attaran@gmail.com
چکیده:   (541 مشاهده)
شکوفایی مضر جلبکی (HABs; Harmful Algae Bloom)که به عنوان کشندسرخ شناخته می شود در واقع ازدیاد گونه های جلبکی است که یا سم تولید می کنند  یا فقط با تراکم زیاد به صورت مستقیم و غیر مستقیم به موجودات آبزی آسیب می رسانند. به منظور شناسایی و بررسی فیلوژنی گونه های داینوفلاژله عامل ایجاد کشند سرخ که در آبان ماه سال 1396 در منطقه بین تالاب لیپار و دریابزرگ  واقع در سواحل جنوب شرقی ایران اتفاق افتاد، نمونه برداری از آب انجام شد. در این کشند گونه Gyrodinium instriatum با تراکم بسیار پایین تر به عنوان گونه جانبی نسبت به گونه ها ی عامل کشند مشاهده گردید. مراحل خالص سازی گونه ها در شرایط آزمایشگاهی انجام شد و ایزوله خالص این گونه در اتاق کشت در محیطی کاملا استریل تحت شرایط 12 ساعت روشنایی و 12 ساعت تاریکی در درجه حرارت ℃ 1± 25 در محیط کشت f2، کشت داده شد. جهت بررسی توالی ژنی، DNA ایزوله خالص استخراج و واکنش زنجیره ای پلی مراز (PCR) انجام شد و توالی ژنی در منطقه ژنی ITS تعیین شده و سپس با توالی ژنی گونه های مشابه در بانک ژن ( (GenBank مقایسه گردید.  بررسی مولکولی و فیلوژنی این گونه نشان داد توالی نوکلئوتیدی گونه موردنظر با 99% بوت استرپ بیشترین شباهت را با گونه G. instriatum  دارد. گونه G. instriatum پراکنش وسیع داشته و در سراسر آب های جهان وجود دارد ومی تواند ایجاد کشند سرخ کند لذا شناسایی دقیق آن امری ضروری و کاربردی می باشد.
 
واژه‌های کلیدی: : داینوفلاژله، Gyrodinium instriatum، توالی ژنی، کشند سرخ، ITS، دریای مکران
متن کامل [PDF 772 kb]   (132 دریافت)    
نوع مطالعه: كاربردي | موضوع مقاله: زيست­ شناسی دريا
دریافت: 1398/4/8 | پذیرش: 1399/3/17 | انتشار الکترونیک: 1399/7/1
فهرست منابع
1. Alverca, E.; Biegala, I.C.; Kennaway, G.M.; Lewis, J. & Franca, S., 2002. In situ identification and localization ofbacteria associated with Gyrodinium instriatum (Gymnodiniales, Dinophyceae) by electron and confocal microscopy. European Journal of Phycology, 37: 523-530. [DOI:10.1017/S0967026202003955]
2. Attaran-Fariman, G., 2007. Dinoflagellater and Chatonella resting stages from recent sediment of south East coast of Iran, PhD thesis, University of Tasmania, Australia, 350 pp.
3. Attaran-Fariman G, Javid P., 2013. The phylogeny of Heterocapsa sp.(Dinophyceae) isolated from the south coast of Iran during a Cochlodinium polykrikoides bloom Turk J Bot 37:778 [DOI:10.3906/bot-1206-40]
4. Attaran-Fariman G, Bolch CJ.,2012. Morphology and Phylogeny of Scrippsiella trochoidea (Dinophyceae) A Potentially Harmful Bloom Forming Species Isolated From The Sediments of Iran's South Coast Iranian Journal of Fisheries Sciences 11:252-270
5. Biegala, I.C., Kennaway, G., Alverca, E., Lennon, J., Vaulot, D. & Simon, N., 2002, Identification of bacteria associated with dinoflagellates (Dinophyceae) Alexandrium spp. using tyramide signal amplification-fluorescent in situ hybridization and confocal microscopy, Journal of Phycology 38:404-411. [DOI:10.1046/j.1529-8817.2002.01045.x]
6. Chikwililwa, C.; McCarron, P.; Waniek, J.J.; Schulz-Bull, D.E., 2019. Phylogenetic analysis and yessotoxin profiles of Gonyaulax spinifera cultures from the Benguela Current upwelling system. Harmful algae.85: 101626 [DOI:10.1016/j.hal.2019.101626]
7. Coats, D.W. & Park, M.G., 2002, Parasitism of photosynthetic dinoflagellates by three strains of Amoebophrya (Dinophyta): parasite survival, infectivity, generation time, and host specificity, Journal of Phycology 38:520-528.1 [DOI:10.1046/j.1529-8817.2002.01200.x]
8. Dale, B., 1983, Dinoflagellate resting cyst: benthic plankton in (G.A. Gryxell, ed.) Survival strategies of the algae University press, Cambridge.
9. Eschbach, E., Scharsack, J.P., John, U. & Medlin, L.K., 2001, Improved erythrocyte lysis assay in microtitre plates for sensitive detection and efficient measurement of haemolytic compounds from ichthyotoxic algae, Journal of Applied Toxicology 21:513-519. [DOI:10.1002/jat.797]
10. Freudenthal, H.D. and Lee, J.J., 1963, Glenodinium Halli n. sp. and Gyrodinium instriatumn. sp., Dinoflagellates from New York Waters, J. Protozool., 10(2), 182-189. [DOI:10.1111/j.1550-7408.1963.tb01659.x]
11. Gárate-Lizárraga, I.; Sevilla-Torres, G.; Álvarez-Añorve, M.; Aguirre-Bahena, F.; Violante-González, J.; Rojas-Herrera, A., 2013. First Record of a red tide caused by Gyrodinium instriatum (Dinophyceae: Gymnodiniales) in Bahía de Acapulco, Guerrero. Cicimar Oceanides.28(1): 43-47
12. Guiry, M.D.; Guiry, G.M., 2020. AlgaeBase. World-wide electronic publication, National University of Ireland, Galway. http://www.algaebase.org; searched on 07 June 2020
13. Hall, T.A., 1999. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. Nucleic Acids Research, Symposium Series,41: 95-98
14. Handy, S.M., Demir, E., Hutchins, D.A., Portune, K.J., Whereat, E.B., Hare, C.E., Rose, J.M., Warner, M., Farestad, M., Cary, S.C. & Coyne, K.J., 2008, Using quantitative realtime PCR to study competition and community dynamics among Delaware Inland Bays harmful algae in field and laboratory studies, Harmful Algae 7:599-613. [DOI:10.1016/j.hal.2007.12.018]
15. Husain, M., 2003, The ecology and taxonomy of marine phytoplankton of Kuwaite with particular emphasis on harmful algae species, PhD thesis University of West Minster. London.
16. Jimenez, R., 1993, Ecological factors related to Gyrodinium instriatum bloom in the inner estuary of the Gulf of Guayaquil, 257-262, In: Smayda, T.J. & Y. Shimizu (Eds.) Toxic Phytoplankton Blooms in the Sea. Elsevier, New York.
17. Kim, K.Y.; Kim, C.H., 2007. Phylogenetic relationships among diverse dinoflagellate species occurring in coastal waters off Korea inferred from large subunit ribosomal DNA sequence data. Algae.22(2): 57-67 [DOI:10.4490/ALGAE.2007.22.2.057]
18. Kojima, N. and Kobayashi, S., 1992, Motile cell-like cyst of Gyrodinium instriatum Freudenthal et Lee (Dinophyceae). Rev. Palaeobot. Palynol., 74, 239-247. [DOI:10.1016/0034-6667(92)90009-6]
19. Matsuoka, K., 1999, Eutrophication Process Recorded in Dinoflagellate Cyst Assemblages-A Case of Yokohama Port, Tokyo Bay, Japan, Sci, Total Environ., 23, 17-35. [DOI:10.1016/S0048-9697(99)00087-X]
20. Matsuoka, K., 1985, Archeopyle structure in modern gymnodinialean dinoflagellate cysts, Review of Palaeobotany and Palynology 44: 217-231. [DOI:10.1016/0034-6667(85)90017-X]
21. Moestrup, Q, Hakanen, P, Hansen. G, Daugbjerg, N, and Ellegaard, M., 2014, OnLevanderina fissa gen.&comb. nov. (Dinophyceae) (syn. Gymnodinium fissum, Gyrodinium instriatum, Gyr. uncatenum), a dinoflagellate with a very unusual sulcus, PhycologiaVolume 53 (3), 265-292. [DOI:10.2216/13-254.1]
22. Nagasoe, S., Kim, D.I., Shimasaki, Y., Oshima, Y., Yamaguchi, M. & Honjo, T., 2006, Effects of temperature, salinity and irradiance on the growth of the red tide dinoflagellates Gyrodinium instriatum Freudenthal et Lee, Harmful Algae, 5: 20-25. [DOI:10.1016/j.hal.2005.06.001]
23. Shao, P. Chen, Y.Q. Zhou, H. Yuan, J. Qu, L.H. Zhao, D. Lin, Y.SH., 2004, Genetic variability in Gymnodiniaceae ITS regions: implications for species identification and phylogenetic analysis, Marine Biology, 144: 215-224. [DOI:10.1007/s00227-003-1157-x]
24. Shikata, T., Nagasoe, S., Matsubara, T., Yamasaki, Y., Shimasaki, Y., Oshima, Y., and Honjo, T., 2007, Effects of temperature and light on cyst germination and germinated cell survival of the noxious raphidophyte Heterosigma akashiwo, Harmful Algae, 6, 700-706. [DOI:10.1016/j.hal.2007.02.008]
25. Silva, E.S. & Franca, S., 1985, The association dinoflagellate-bacteria: their ultrastructural relationship in two species of dinoflagellates, Protistologica 21:429-446.
26. Silva, E.S., 1982, Relationship between dinoflagellates and intracellular bacteria. In: Hoppe HA, Levring T (eds) Marine Algae in Pharmaceutical Science. 2. Walter de Gruyter, Berlin, pp 269-288 [DOI:10.1515/9783110837506-015]
27. Su, H.M. & Chiang, Y.M., 1991, Dinoflagellates collected from aquaculture ponds in Southern Taiwan, Japanese Journal of Phycology 39:227-238.
28. Tomas, C.R., Zimmermann, L.A & Smith, M.D., 2004, Gyrodinium instriatum. North Carolina Sea Gran, Marine Phytoplankton Identification Series. UNC-SG-00-0X.
29. Uchida, T., Matsuyama, Y., Yamaguchi, M and Honjo, T., 1996, The life cycle of Gyrodinium instriatum (Dinophyceae) in culture, Phycol. Res., 44, 119-123. [DOI:10.1111/j.1440-1835.1996.tb00040.x]
30. Uchida, T., Toda, S., Matsuyama, Y., Yamaguchi, Y., Honjo, T., 1999, Interactions between the red tide dinoflagellates Heterocapsa circularisquama and Gymnodinium mikimotoi in laboratory culture, Journal of Experimental Marine Biology and Ecology, 241, 285-299. [DOI:10.1016/S0022-0981(99)00088-X]
31. Wang, Z., Qi, Y., Yin, Y., Jiang,T., & Xie, L., 2001, Studies on the cause and the occurrence reasons of a Gyrodinium instriatum red tide in Shenzhen Bay in spring of 1998. Marine Science, 25(5):47-50.
32. Wang, Y., Yu, Z., Song, X., Zhang, Sh., 2006, Intraction between the bloom- forming dinoflagellatrs Prorocentrum donghaiense and Alexandrium Tamarense in laboratory cultures, Journal of sea Research 56 (1), 17-26. [DOI:10.1016/j.seares.2006.04.002]
33. Xu, F.L., Yang, B., Yang, C., Shuang, H.Q., Kong, X.Z., Wang, Q.M., Ouyang, H.L., Qin, N., Liu, W.X., He, W., Jiang, Y.J., 2014, The seasonal and spatial variations of phytoplankton community andtheir correlation with environmental factors in a large eutrophicChinese lake (Lake Chaohu), Ecological Indicators. 40 : 58-67. [DOI:10.1016/j.ecolind.2014.01.006]
34. Zadabbas Shahabadi, Z. Attaran Fariman G. Farahmand,H., 2011, Gyrodinium instriatum internal transcribed spacer 1, partia sequence; 5.8S ribosomal RNA gene, complete sequence; and interna transcribed spacer 2, partial sequence. https://www.ncbi.nlm. nih.gov/nuccore/JN020162.
35. Yamasaki, Y., Nagasoe, S., Matsubara, T., Shikata, T. Shimasaki, Y., Oshima, Y., Honjo, T., 2007, Growth inhibition and formation of morphologically abnormal cells of Akashiwo sanguinea (Hirasaka) 32. G. Hansen et Moestrup by cell contact with Cochlodinium polykrikoides Margalef, Marine Biology 152 (1), 157-163. [DOI:10.1007/s00227-007-0671-7]
ارسال پیام به نویسنده مسئول

ارسال نظر درباره این مقاله
نام کاربری یا پست الکترونیک شما:

CAPTCHA


XML   English Abstract   Print


Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:

Attaran Fariman n G. phylogenic study of dinoflagellate Gyrodinium instriatum simultaneous occurrences during redtide of Gonyaulax polygramma isolated from the coastal waters of Ramin (Makoran Sea). joc. 2020; 11 (41) :73-81
URL: http://joc.inio.ac.ir/article-1-1422-fa.html

عطاران فریمان گیلان، دولت آبادی فائزه، لقمانی مهران. فیلوژنی داینوفلاژله Gyrodinium instriatum گونه جانبی در هنگام کشند سرخ گونه Gonyaulax polygramma جدا شده از آب های ساحلی رمین (دریای مکران). نشریه علمی - پژوهشی اقیانوس شناسی. 1399; 11 (41) :73-81

URL: http://joc.inio.ac.ir/article-1-1422-fa.html



دوره 11، شماره 41 - ( 1399 ) برگشت به فهرست نسخه ها
نشریه علمی پژوهشی اقیانوس شناسی Journal of Oceanography
Persian site map - English site map - Created in 0.09 seconds with 29 queries by YEKTAWEB 4263